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二者各有各的特点 ，评价好与不好和个人的观点和角度不同，下面介绍一下二者的主要区别：
一、学校历史不同
1 、西南医科大学
学校始于1951年建立的西南区川南医士学校 ，1959年更名为泸州医学专科学校 ，1978年升格为泸州医学院，1982年 ，学校获得学士学位授予权 ，1993年，学校经国务院学位委员会批准成为硕士学位授权单位；2010年获准设立博士后科研工作站 ，2015年4月更名为四川医科大学 ，12月更名为西南医科大学。
2 、川北医学院
学校前身是1951年创办的西南区川北医士学校，1965年升格为专科 ，1985年升格为本科 ，定名为川北医学院 。
二、学校规模不同
1 、西南医科大学
截至2020年，学校有忠山 、城北两个校区，占地2011亩 。下设19个院（系）有医教员工8000余人 ，有专任教师1254人 ，在校本科生、研究生 、留学生等近两万人。
2 、川北医学院
截至2020年，学校建有南充顺庆、南充高坪两个校区 ，占地面积1300余亩 ，学校有18个教学单位，有全日制学生16000余人 。
三 、院系设置不同
1 、西南医科大学
基础医学院 ，临床医学院 ，中西医结合学院，口腔医学院 ，护理学院 ，公共卫生学院等19个院（系） 。
2、川北医学院
临床医学系 、医学影像学系 、医学检验、口腔医学系、麻醉系等18个教学单位。
四 、学校特色不同
1 、西南医科大学
省属普通本科高校、卓越医生教育培养计划（2012年） 、卓越医生（中医）教育培养计划（2015年） 、临床医学硕士专业学位研究生培养模式改革试点高校、临床医学专业综合改革试点高校
、四川2011计划（2014年） 、四川省卓越法律人才教育培养计划 。
2、川北医学院
普通高等院校 、卓越医生教育培养计划 。
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